自考档案一般存放在人才交流中心或村委会。没有正式工作单位的考生，可存放在户籍所在地人才交流中心、城市街道办事处或农村村委会，也可安置在当地人才交流中心。

自考考生在学习期间的档案统称为“学籍档案”。自考生毕业后，学籍档案原件应尽快放入自己的人事档案，并存放在相关人事部门。自考生的学籍记录主要是《毕业生登记表》(全日制自考生也有《考生毕业考试表》)，其中包括毕业生姓名、专业、区县、每次参考时间、准考证及身份证号、联系电话、毕业考试部门签署的意见等重要证明信息。自考毕业申请批准后，市考办将自考考生的毕业证书原件和学籍档案材料盖章后发给自考考生。自学考生将根据个人情况，以合理的方式纳入个人档案。

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